根据现行铁路机务规章及动车组司机作业考核标准，动车组司机在侧线进站制动调速时，若速度低于允许速度值5km/h，属于操纵违章行为，将依据《动车组司机标准化作业与操纵检查评比标准》及相关考核办法进行扣分。具体扣分分值需结合铁路局集团公司现行有效的乘务员违章违纪考核细则确定。一般来说，此类行为在司机操纵技能考核中属于“动车组操纵”项下的调速不当，通常扣减10至20分不等；若造成列车超速防护设备动作或影响安全，扣分更高，甚至可能触发“12分”扣分制中的离岗培训。现场作业时，应以铁路局集团公司最新发布的《机车乘务员违章违纪考核办法》或《动车组司机一次作业标准》为准。

参考资料：

1. 《《CRH系列动车组司机安全正点平稳操纵检查评比标准》（2011年，背景资料）》
2. 《铁路局集团公司现行《动车组司机操纵考核细则》》
3. 《《铁路机车运用管理规则》现行版本》

知识来源：铁道职培APP已审核知识库（KB-TX-CAEA88A0）。
说明：本文仅供学习参考；涉及规章、技术参数和现场作业要求时，以现行有效文件为准。