动车组司机盲目切除安全保护设备属于严重违章行为，直接危及行车安全。依据《铁路安全管理条例》及国铁集团相关安全规章，对这类行为的处理应遵循“立即纠正、严肃追责、系统整改”的原则。

首先，一旦发现司机擅自切除ATP（列车自动防护系统）、LKJ（列车运行监控装置）等安全保护设备，列车调度员或添乘人员应立即责令其恢复设备功能，并在前方站停车检查。若设备无法恢复，必须按规定申请救援或限速运行，严禁继续冒险行车。同时，应将事件信息立即上报铁路局集团公司安全监察部门，启动调查程序。

其次，在责任追究方面，依据《铁路交通事故调查处理规则》和《中国铁路总公司关于明确铁路从业人员作业纪律的规定》，对盲目切除安全保护设备的司机，视情节轻重给予警告、记过、降级、撤职直至解除劳动合同的处分。若造成事故或严重后果，还将依法追究法律责任。例如，2023年某铁路局一名动车组司机因误判ATP故障擅自关机，被给予撤职处分并调离司机岗位。

再次，铁路企业应开展专项安全教育和案例警示，组织全体动车组司机学习安全保护设备的工作原理和应急处置流程，强化“红线”意识。同时，完善机车车载数据分析系统，对设备切除操作进行实时监控和记录，杜绝类似行为再次发生。此外，还应定期检查安全保护设备的可靠性，确保其性能良好。

最后，需强调的是，动车组司机必须严格遵守《高速铁路行车组织细则》和《铁路技术管理规程》中关于安全保护设备使用的规定。除紧急情况按规定程序操作外，严禁任何形式的盲目切除行为。对于确需切除的故障处理，必须先停车、报告并获得调度命令方可进行。

综上，处理动车组司机盲目切除安全保护设备的行为，应坚持“零容忍”态度，通过现场纠正、严肃追责、系统整改和教育培训等多措并举，确保铁路运输安全。

参考资料：

1. 《《铁路安全管理条例》（国务院令第639号）》
2. 《《铁路交通事故调查处理规则》（交通运输部令2018年第4号）》
3. 《《中国铁路总公司关于明确铁路从业人员作业纪律的规定》（铁总运〔2015〕102号）》

知识来源：铁道职培APP已审核知识库（KB-GD-69807EB8）。
说明：本文仅供学习参考；涉及规章、技术参数和现场作业要求时，以现行有效文件为准。

相关阅读：

1. 动车组区间故障换乘，现场处置先抓哪几条线？
2. 高铁接触网运维安全培训中的易错点与应急处置辨析
3. 接触网“V”形天窗作业，安全距离与接地环节的教学关键