根据《技规》（普速铁路部分）第316条规定，处理方式如下：

    ‌立即停车‌：列车必须在该通过信号机前停车‌。
    ‌联系相关人员‌：司机应使用列车无线调度通信设备通知车辆乘务员（随车机械师）‌。
    ‌等待并确认信号‌：
        停车等候2分钟后，若该信号机仍未显示允许运行的信号，列车可以‌不超过20km/h的速度‌继续运行至次一通过信号机（或进站信号机），并按新信号机的显示要求运行‌23。
        在停车等待期间，必须与车站值班员、列车调度员联系。如确认前方闭塞分区内有列车，则禁止进入‌。

‌特殊情形‌：

    若通过信号机灯光熄灭（而非显示停车信号），且机车信号显示允许运行的信号时，则按机车信号的显示运行‌。

‌注意‌：

    上述规则不适用于装有容许信号的通过信号机显示停车信号的情形（允许特定货物列车不停车通过）‌23。
    司机发现信号机故障时，需将故障信号机编号通知前方站或列车调度员‌3。

综上，问题中描述的“通过信号机显示停车信号”场景，‌必须严格执行停车、联系、限速运行流程‌‌23，与“灯光熄灭且机车信号允许”的情形存在区别‌45。

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